進学を検討するうえで最大の検討事項となるのが学納金です。名古屋経営短期大学の初年度納付金は、入学金・授業料・施設設備費等を合わせて約120万〜135万円前後（学科・諸会費によって変動）となっており、愛知県内の私立短期大学の標準的な相場に位置しています。
家計の負担を軽減するため、学校法人菊武学園独自の奨学金制度や特待生制度が用意されています。成績優秀者や指定資格保有者を対象とした学費減免制度のほか、国の「高等教育の修学支援新制度（授業料減免＋給付型奨学金）」の対象校にも選定されています。支援条件を満たす世帯であれば、自己負担額を大幅に抑えて卒業を目指すことが可能です。
