杉乃井ホテルの水辺アクティビティを最大限に堪能するためには、まず性質のまったく異なる2つの施設を正しく区別しなければなりません。南国リゾート風の全天候型屋内プール「アクアビート」は、天候や紫外線を一切気にせず遊べる夏季限定のアミューズメント特化型施設です。波が押し寄せる「アクアビーチ」や、スリル満点のスライダー、水深の浅いキッズプールが揃い、子どもの歓声が響き渡るエンタメ空間となっています。
対照的に、通年営業している「アクアガーデン」は、水着で入る露天型温泉プールです。海抜約250メートルから別府の街並みと別府湾を一望できる開放感が最大の魅力であり、夜間には幻想的な光と音の噴水ショーが開催されます。日中の暑い時間帯はアクアビートでアグレッシブに泳ぎ、夕暮れ時から夜にかけてはアクアガーデンで温泉の温もりに包まれながらリラックスするというリレーが、別府温泉ならではの黄金ルートです。