チームラボプラネッツ最大の特徴は、文字通り「水に入るミュージアム」である点です。入館直後に全員が靴と靴下を脱ぎ、完全な裸足になってロッカーに手荷物をすべて預けます。このユニークな体験をトラブルなく楽しむためには、入館前の服装選びが鍵となります。
水深は大人の膝下（約30cm程度）に達するエリアがあります。そのため、裾を膝上まで無理なく捲り上げられるズボンが必須です。タイトなスキニーパンツや硬いデニムは捲り上げが難しいため避けるべきです。また、床面が全面鏡張りになっている作品空間（無限のクリスタル宇宙や花の空間）が点在しているため、スカートで入場すると下から下着が映り込みます。施設側でハーフパンツの無料貸し出しも用意されていますが、最初から捲りやすいパンツスタイル、またはインナーにショートスパッツを着用して来館するのが快適です。
無料のダイヤル式ロッカーが完備されているため、スマートフォンとカメラ以外の荷物はすべて収納します。水没リスクを避けるため、首掛けのスマホストラップを持参すると撮影時の落下を防げます。水から上がった直後には各所に吸水性の高い専用タオルが用意されており、足を拭いて次のドライエリアへ進む動線が整っています。
